Сергей Сергеевич Монахов родился в 1984 году в г. Москва. В 2006 году окончил с отличием Московскую академию экономики и права.
С 2006 по 2008 годы работал на должностях старшего следователя Мытищинской городской прокуратуры Московской области, старшего следователя и следователя по особо важным делам следственного отдела по городу Мытищи следственного управления Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации по Московской области.
С 2008 по 2011 годы проходил службу на должностях старшего референта отдела процессуального контроля следственного управления Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации по Московской области, заместителя руководителя следственного отдела по городу Видное следственного управления Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации по Московской области, заместителя руководителя следственного отдела по городу Видное следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по Московской области, заместителя руководителя следственного отдела по городу Мытищи.
С 2011 по 2018 годы замещал должности старшего инспектора отдела процессуального контроля за расследованием особо важных дел о преступлениях против государственной власти и в сфере экономики управления процессуального контроля за расследованием особо важных дел Главного управления процессуального контроля Следственного комитета Российской Федерации, старшего инспектора отдела процессуального контроля (за расследованием преступлений, совершенных несовершеннолетними и в отношении несовершеннолетних) управления процессуального контроля за расследованием особо важных дел в федеральных округах Следственного комитета Российской Федерации и отдела процессуального контроля за расследованием преступлений, совершенных несовершеннолетними и в отношении несовершеннолетних управления процессуального контроля за расследованием отдельных видов преступлений Следственного комитета Российской Федерации.
С 2018 по 2020 годы работал в должности инспектора восьмого отдела (служебных проверок) управления кадров Следственного комитета Российской Федерации.
Приказом Председателя Следственного комитета Российской Федерации от 18.02.2020 № 92-кт Монахов Сергей Сергеевич назначен на должность заместителя руководителя следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по Тверской области.